دراسة للبروتينات الافتراضية الناقلة للاشارات في البكتريا Helicobacter pylori

Abstract

اجري مسح للبروتينات الافتراضية للبكتريا Helicobacter pylori  السلالة 26695 وكان عددها 714 (41.58 %) من بروتينات / جينات البكتريا المدرجة في قاعدة البيانات MBDG . مسحت البروتينات لتحديد ضراوتها وكان 82.2 % هي بروتينات ضراوة . استعمل ProtFunc Server  لتحديد مجاميع البروتينات الوظيفية وفقا لتصنيف Gene Ontology  ، اختيرت البروتينات العاملة في نقل الإشارات من البروتينات الافتراضية نظرا لأهميتها وهي (HP0085   ، HP0079، PS235، HP0203، HP0155 ، HP0249، HP0583، HP0856، ST515 ، HP1527، PS1632، HP1163 ، PS1350، HP1085 ، HP1436). درست إمكانية حدوث التحويرات بعد الترجمة مثل الفسفرة التي لم تظهر نتائج واضحة لعدة أسباب ، درس ايضا إضافة السكريات N-Glycosylation  و O-Glycosylation  وكانت الحالة الأولى أكثر تكرارا . تم تحديد التراكيب الثنائية والثلاثية للبروتينات وإيجاد البروتينات الأقرب التي لها تراكيب محددة بالأشعة السينية والرنين النووي المغناطيسي . أظهرت نتائج التداخل مع مكونات الخلية ان هناك تداخلا كبيرا لمعظم البروتينات المدروسة  .